在《本經疏證》一書中，用不下于6000字的長文，結合張仲景在《傷寒雜病論》中對于生姜與干姜的具體運用，深刻地剖析并闡明了二藥之異同。
生姜與干姜，兩味藥皆味辛，性偏于溫或熱，皆可入于肺、脾、胃經，其功效皆可溫肺與溫中，為散寒之要藥。
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仲景無論是治外感或治內傷，皆常使用。
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最著名的代表方如桂枝湯、生姜瀉心湯之用生姜，理中湯和四逆湯之用干姜。
然而，二藥也確實有所區別。
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《本經》對于姜藥性的記載，其前面一截之“味辛，溫，大熱，無毒，主胸滿，咳逆上氣，溫中，止血”是言干姜；而后面一截之“出汗，逐風濕痺，腸澼，下痢”是屬生姜。
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《別錄》對此二藥藥性的記載也有所不同，即干姜“主治寒冷腹痛，中惡，霍亂，脹滿止唾血”;生姜則“主治傷寒頭痛，鼻塞，咳逆上氣，止嘔吐”。
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這說明二者的主治是有差異的。
概要言之：
生姜與干姜，不僅特味有厚薄，氣亦有厚薄，俗話說“嫩姜沒有老姜辣”。
凡系陰邪搏陽，當使陰橫散，陽乃暢通者，生姜皆能主之。如治“身體如風痺狀”之桂枝黃芪五物湯，因其證為“陰外裹而在內之陽不振”，故倍生姜逐在外之陰邪束縛，使腎陽外布。
再如生姜半夏湯證之“胸中似嘔不嘔，似噦不噦，徹心中憒憒然無奈者”，乃系寒邪挾飲逼迫氣分，故也重用生姜以驅飲散寒。
生姜又多與大棗同用，尤能治汗后虛邪勢將入里者。
二藥并用，不僅取其辛甘發散，更重要的是取大棗能“助十二經，補少氣少津液，身中不足”。
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《傷寒論》用生姜方凡三十有五，而協棗者至二十有九；《金匱要略》用生姜方除經見《傷寒論》者，猶三十有二，其協棗者亦一十有八，統而計之，其不同棗用者僅十之三。”
如主“出汗”及調和營衛之桂枝湯，“逐風濕痺”之桂枝附子湯、白術附子湯、桂枝芍藥知母湯、桂枝黃芪五物湯，以及治“出汗”、往來寒熱之小柴胡湯等方中皆生姜與大棗并用。
干姜，其“辛，溫、大熱”之性過于生姜，除為脾肺藥外，尚可兼入心、腎經，為理中、補虛、驅寒之要藥。
在理中湯證（既吐且利，寒多不欲飲水，或胸痺，心中痞，留氣結在胸，胸滿，脅下逆搶心）之所以用之者，就在于其病機為“中無所守”，“蓋惟中虛，是以客氣得入；惟中寒，是以不能逐而使出，故理中補虛，即其制出之權；其驅寒，即其制入之威”，從而使中氣得守。
在理中湯基礎上加減變化而成的桂枝人參湯、干姜人參半夏丸、薯蕷丸和旋覆代赫石湯等方，都無不“恃姜為卻寒散滿之長城”，即使是對待以寒涼，而治中焦寒熱不和之半夏瀉心湯證、黃連湯證等，也都恃干姜之作用不淺。
干姜所治為在中之水飲，非在上之痰。故小青龍湯、真武湯中用之。
由于干姜受氣足，足則上達肺，下通大腸，外及皮毛，中鎮沸逆。而生姜則受氣微，微則僅能由中及上，故止散外感、止嘔吐耳。
又因干姜得秋氣多，故功兼收斂，長于溫中回陽而在四逆湯中用之。尤其是通脈四逆湯證，以病既植根中氣之虛而中寒，所以方中要倍用干姜。
干姜能溫經止血，故仲景在柏葉湯、桃花湯等虛寒性之出血證方中用之，但須泡過后用。
炮姜有黑與不黑之殊，不黑者（僅用砂燙至鼓起，表面呈棕褐色）治血分虛寒而無熱，如產后血虛發熱之類；黑者則治中氣虛而化熱以傷血者，如唾血、利血之類。治化熱傷血者，干姜最好以童便炮制為宜。
至于上虛不能制下之甘草干姜湯證，因用干姜尚嫌其橫溢而肺益虛，故亦需炮用，炮過后，可以自肺及脾及腎也。
總而言之：
*?干姜味辛氣溫，能令外不敢入；性守不走，能令內不敢出，重在一個“守”字。
*?生姜功在橫散，長于發汗解表止嘔，散陰以暢陽，故《本經》言其“久服去臭氣，通神明”，現代治中風方劑中亦多用生姜取汁。
*?干姜可代生姜，生姜不可代干姜。
*?嘔者多用生姜，間亦用干姜。
*?咳則必用干姜，不得用生姜。
*?調中可混用生姜與干姜，但解外不可混用。
*?干姜之治嘔為兼及他證，而用生姜則專治嘔。
另外，四逆湯有附無姜，“難取堅壁不動之效”；“干姜既得附子，一主其中，一主其下，一主守，一主走，若輕車，若熟路，風行雷動，所當必摧，所擊必敗，陰散斯陽歸，陽歸斯病已”。
所以，干姜與附子合用，可以稱為回陽救逆之絕配，或稱最佳組合。
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